Обезличить - не значит заменить «Иванова» на «пациента И.». Значит убрать всё идентифицирующее: имя, телефон, адрес, точные даты, номер карты, редкие сочетания обстоятельств, по которым человека можно вычислить.
Практический тест: если текст случайно окажется в чужих руках - можно ли по нему понять, о ком речь? Если да - обезличено плохо. Клиническая суть при этом сохраняется полностью: жалобы, картина, план. Именно с такими текстами нейросеть и должна работать.